随着互联网技术的不断发展，论文查重软件已经成为了各大高校和科研机构必备的工具。但是，在使用论文查重软件时，很多人会遇到格式兼容性的问题。对于一些格式比较特殊的论文，不兼容的情况时有发生。针对这个问题，我们进行了调研和实验，发现了一些兼容性较好的论文查重软件。其中，Turnitin、iThenticate、Grammarly等软件的兼容性表现较为优秀。

除了推荐一些兼容性较好的论文查重软件，我们还建议在写论文时，尽量避免使用过于复杂的格式，以免出现兼容性问题。此外，在上传论文之前，最好先进行格式检查，确保论文格式规范统一。这样不仅可以避免兼容性问题，还可以提高论文的质量和排版效果。